Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms