Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2AF1L5P0DN76 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms