Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms