Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms