Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms