Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA1P02647 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA1P02647 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOA1P02647 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms