Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
F9P00740 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
F9P00740 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
F9P00740 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
F9P00740 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
F9P00740 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F9P00740 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F9P00740 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F9P00740 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F9P00740 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
F9P00740 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F9P00740 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms