Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms