Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX6O95475 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX6O95475 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX6O95475 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX6O95475 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX6O95475 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX6O95475 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX6O95475 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX6O95475 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX6O95475 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms