Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRATO95237 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRATO95237 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRATO95237 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRATO95237 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms