Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM1O95202 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM1O95202 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM1O95202 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM1O95202 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETM1O95202 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETM1O95202 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETM1O95202 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETM1O95202 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETM1O95202 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETM1O95202 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETM1O95202 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM1O95202 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms