Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP2O75604 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP2O75604 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP2O75604 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP2O75604 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP2O75604 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP2O75604 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP2O75604 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP2O75604 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP2O75604 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP2O75604 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP2O75604 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP2O75604 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP2O75604 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP2O75604 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP2O75604 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP2O75604 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP2O75604 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP2O75604 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP2O75604 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms