Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GMDSO60547 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GMDSO60547 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GMDSO60547 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GMDSO60547 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GMDSO60547 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms