Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUBNO60494 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUBNO60494 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms