Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP9BO43861 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms