Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms