Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3EO15041 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms