Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
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