Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms