Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PMD0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PMD0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PMD0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PMD0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PMD0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PMD0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PMD0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PMD0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PMD0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PMD0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PMD0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms