Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms