Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A4D1N5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4D1N5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms