Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms