Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FAM187BQ17R55 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms