Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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