Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD12P35452 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms