Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
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