Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms