Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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BRD3Q15059 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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