Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR486-2-201ENST00000637446 64 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PGM2L1-201ENST00000298198 8515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NWD1-205ENST00000549814 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SECISBP2-209ENST00000534113 3584 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 STX17-201ENST00000259400 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 YOD1-201ENST00000315927 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGRP4-201ENST00000293062 2926 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGRP4-203ENST00000433821 2941 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGRP4-215ENST00000614135 2942 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGRP4-218ENST00000617966 2927 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DPP9-201ENST00000262960 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FBXO10-202ENST00000432825 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HHAT-206ENST00000537898 3446 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ATF7IP-221ENST00000543189 4887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SEC61A1-201ENST00000243253 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 JAK3-207ENST00000534444 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP2R5C-203ENST00000350249 3845 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PROM1-207ENST00000508167 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZMYND11-207ENST00000397959 4138 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAPGEF3-204ENST00000405493 5751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OLFML2B-203ENST00000367940 2685 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TFIP11-202ENST00000407148 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01163-202ENST00000630252 3086 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 C14orf93-201ENST00000299088 3354 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLIP1-219ENST00000620786 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FGF5-201ENST00000312465 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LY9-205ENST00000392203 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092145.1-201ENST00000564809 2434 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCN5-203ENST00000376091 3046 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NVL-216ENST00000482491 3003 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms