Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms