Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL135P-201ENST00000490144 278 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AP006587.2-201ENST00000530696 493 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 KARS-209ENST00000568378 459 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SSX2B-204ENST00000616191 1344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SP140-202ENST00000373645 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR1269A-201ENST00000408636 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RDH11-202ENST00000428130 1064 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL157392.2-201ENST00000449462 474 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SOX2-OT-202ENST00000461063 566 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms