Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MAPK10-252ENST00000640970 2620 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MAPK10-333ENST00000641607 2481 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms