Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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