Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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