Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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