Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms