Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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