Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms