Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms