Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRBQ9Y5M8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms