Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR3KQ9Y2Y1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms