Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms