Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH4Q9UQ05 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH4Q9UQ05 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH4Q9UQ05 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH4Q9UQ05 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH4Q9UQ05 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH4Q9UQ05 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms