Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms