Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms