Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms