Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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