Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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