Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms